R FAQ v2.4 - 5章の日本語訳 (5.1.2 [a-c])

aaMI: タンパク質配列のアライメントに関する相互情報量.
abind: 多次元配列を連結します.
accuracy: 統計計算の精度を向上し, 検証するために設計されたツール集.
acepack: 回帰変換を選択するための ACE (Alternating Conditional Expectations (交替条件付き期待値)) および AVAS (Additivity and VAriance Stabilization for regression (回帰のための加法性および分散安定化)) 手法.
actuar: 保険数理 (actuarial science) のアプリケーションに関連した関数群.
ada: 2値応答に関するブースティング・アルゴリズムを実行します.
adabag: Adaboost.M1 およびバギング (Bagging).
adapt: 20次元までの適応型求積法.
ade4: 多変量データ分析およびグラフィカル表示.
ade4TkGUI: ade4 のための Tcl/Tk グラフィカル・ユーザー・インターフェイス.
adehabitat: 動物による生息地選択の分析のためのツール集.
adimpro: ディジタル画像の適応型平滑化.
adlift: 信号のノイズ除去のための適応型ウェーブレット変換.
agce: 成長曲線の実験の分析.
agricolae: 農業研究のための統計的処理.
agsemisc: 種々のプロットおよびユーティリティ関数群.
akima: 不規則なグリッド・データのための線形あるいは 3次スプライン補間.
allelic: 高速で偏りがなく正確な, 対立遺伝子の正確確率検定 (allelic exact test).
alr3: S. Weisberg 著の教科書 "Applied Linear Regression", 2005, Wiley に添付の手法とデータ.
amap: もう 1つの多次元分析パッケージ (Another Multidimensional Analysis Package).
analogue: 古生態学のための類似物 (analogue) の諸手法.
aod: 過分散データの分析 (Analysis of Overdispersed Data).
apTreeshape: 系統樹形の分析 (Analyses of phylogenetic treeshape).
ape: 系統発生および進化の分析 (Analyses of Phylogenetics and Evolution). 括弧形式 (標準 Newick 形式) の系統樹の読み込みとプロット, 系統発生の枠組みでの比較データの分析, 多様性および大進化の分析, 対立遺伝子およびヌクレオチド・データからの距離の計算, インターネット経由での GenBank からのヌクレオチド配列の読み込みのための関数群や, Mantel 検定, 最小全域木の計算, あるいは種々のアプローチに基づく母数 (population parameter) theta の計算等の多数のツールを提供します.
aplpack: もう 1つのプロット・パッケージ (Another PLot PACKage): stem.leaf, bagplot, faces, spin3R, ....
arm: 回帰および多層/階層モデルを用いたデータ分析.
arules: R を用いた相関ルールおよび頻出アイテムセットのマイニング.
ash: 1D および 2D 密度推定のための David Scott の ASH ルーチン.
aspace: 空間点パターンからセントログラフィ統計および計算幾何を推定します.
assist: 平滑化スプラインを実装する関数一式.
aster: Aster モデリング (生活史形質モデリングのための森グラフ (forest graph) の指数分布族の条件付き/条件なしのカノニカル統計モデル) のための関数群およびデータセット.
asypow: 漸近的尤度比の手法を用いた, 検出力および関連量を計算するルーチン集.
aws: 適応型重み平滑化 (adaptive weights smoothing) を実行するための関数群.

backtest: 金融商品についてポートフォリオに基づく仮説を探求します.
bayesSurv: 柔軟な誤差分布を (そして後に変量効果分布も) 持つベイズ型生存回帰.
bayesm: マーケティング/ミクロ計量経済学 (Micro-econometrics) のためのベイズ推論.
bayesmix: JAGS を用いた 1変量ガウス分布のベイズ混合モデル.
bcp: Barry and Hartigan の積分割モデル (product partition) に基づくベイス流の変化点 (Bayesian Change Point) 分析.
betareg: 比率や割合をモデル化するためのベータ回帰.
bicreduc: 2変量区間打ち切りデータ (bivariate interval-censored data) の分布関数についての NPMLE (ノンパラメトリック最尤推定量) のための縮小アルゴリズム (reduction algorithm).
biglm: メモリーで当てはめを行うには大きすぎるデータの線形回帰.
bim: ベイズ区間マッピング診断: QTLCart および Bmapqtl の標本を解釈するための関数群.
bindata: 相関のある人工的な 2値データの生成.
binom: いくつかのパラメーター化 (パラメタリゼーション) による 2項分布の信頼区間.
biopara: R 用の自己完結型並列システム.
bitops: 整数ベクトルの 2項演算のための関数群.
bivpois: EM アルゴリズムを用いた 2変量ポアソン・モデル.
blighty: 英国の海岸線を描くための関数群.
blockrand: ブロック・ランダム (block random) 臨床試験のためのランダム化.
boa: MCMC のためのベイズ出力分析 (Bayesian Output Analysis) プログラム.
boolean: ブール型ロジットおよびプロビット: ブール型仮説を検証するための手続き.
boost: 実データおよびシミュレーション・データのためのブースティング手法. `BagBoost', `LogitBoost', `AdaBoost', および `L2Boost' という機能を持っています.
boot: A. C. Davison and D. V. Hinkley 著の書籍 "Bootstrap Methods and Their Applications", 1997, Cambridge University Press からのブートストラップのための関数群およびデータセット. 推奨 (Recommended).
bootstrap: B. Efron and R. Tibshirani 著の書籍 "An Introduction to the Bootstrap", 1993, Chapman and Hall に関するソフトウェア (ブートストラップ, 交差検定, ジャックナイフ), データ, および正誤表.
bqtl: 同系交配および組み換え近交系についての QTL マッピング・ツールキット. 最大尤度およびベイズ手法のツール群を含んでいます.
brainwaver: グラフ理論を用いた可視化およびパラメーター化機能を持つ多変量時系列の基本的なウェーブレット分析.
brlr: 偏りを減らしたロジスティック回帰 (bias-reduced logistic regression): 罰則付き最大尤度によるロジスティック回帰の当てはめ.
butler: R 用の単体テスト, 性能測定およびベンチマーク.

caMassClass: タンパク質の質量スペクトル (SELDI) データの処理と分類.
caTools: 種々のユーティリティ関数群. ENVI バイナリー・ファイルの読み書き, LogitBoost クラシファイア, および base64 エンコーダー/デコーダーを含みます.
cacheSweave: Sweave の計算結果をキャッシュに入れるためのツール群.
cairoDevice: ロード可能な CAIRO/GTK デバイス・ドライバー.
calibrate: バイプロットの軸の調整.
car: 応用回帰の手引き (Companion to Applied Regression). 応用回帰, 線形モデル, および一般化線形モデルについての関数群を含みます. 回帰診断, とくにグラフィカルな診断手法に重点が置かれています.
cat: 欠損値を含んだカテゴリー変数のデータセットの分析.
catspec: カテゴリー変数についての特別なモデル.
cba: ビジネス・アナリティクスのためのクラスタリング. Proximus and Rock の実装を含みます.
cclust: 凸クラスタリング (convex clustering) 手法. k-means アルゴリズム, オンライン・アップデート・アルゴリズム (ハードな競合学習) および Neural Gas アルゴリズム (ソフトな競合学習) およびデータセット内のクラスター数を発見するためのいくつかの指標の計算を含みます.
cfa: configuration frequencies (配置頻度?) の分析.
cgh: Smith-Waterman アルゴリズムを用いたマイクロアレイの比較ゲノム・ハイブリダイゼーション (comparative genome hybridisation (CGH)) データの分析.
chplot: 拡張された凸包プロット (augmented convex hull plots):グループ分けされた 2変量データについての情報豊富な美しいプロット.
changeLOS: 病院入院期間 (length of hospital stay (LOS)) における変化.
chemCal: 分析化学のための校正関数群.
chron: 暦年オブジェクト (時刻および日付) を扱うためのパッケージ.
circular: Rao Jammalamadaka and A. SenGupta 著 "Topics in Circular Statistics", 2001, World Scientific からの Circular Statistics (角度や方向の性質を考慮した統計学).
clac: Clust Along Chromosomes, CGH アレイ・データにおける過剰/欠失を判定するための手法.
class: 分類 (k-最近傍および LVQ) のための関数群. `VR' バンドルに含まれます. 推奨 (Recommended).
classInt: マッピングやその他のグラフィクスの目的で 1変量の階級幅を選択します.
classPP: 教師あり分類のための射影追跡 (Projection Pursuit).
classifly: 高次元の分類モデルを探索します.
clim.pact: 月次・日次データについての気候分析 (climate analysis) およびダウンスケーリング.
climatol: 気候学的 (月次) 系列内の欠損データを補ったり, それらのデータの均一性を検証するための関数群と, さらに, 風配図や Walter&Lieth のダイアグラムを描くための関数群.
clines: 等高線を計算します.
clue: クラスター集合体 (CLUster Ensembles).
clustTool: 空間情報を持つデータをクラスタリングするための GUI.
cluster: クラスター分析のための関数群. 推奨 (Recommended).
clusterGeneration: ランダムなクラスターの生成 (所定の分離度で).
clusterRepro: 遺伝子発現クラスターの再現性 (Reproducibility).
clustvarsel: モデル・ベースのクラスタリングのための変数選択.
cmprsk: 競合リスク (competing risks) における部分分布関数の推定, 検証および回帰モデリング.
cobs99: 制約付き B-スプライン (Constrained B-splines): 旧式となった 1999年ヴァージョン.
cobs: 制約付き B-スプライン (Constrained B-splines): 線形計画法および疎行列による定性制約型 (回帰) 平滑化.
cocorresp: 群集生態学のための co-correspondence (共対応?) 分析の序列化手法 (Co-correspondence analysis ordination methods for community ecology).
coda: マルコフ連鎖モンテカルロ (MCMC) のシミュレーションについての出力分析および診断.
coin: 一般的な独立性の問題についての条件付き推測 (COnditional INference) の方法. 2標本, K-標本, 相関, 打ち切り, 順序, および多変量問題を含みます.
colorspace: いろいろな色空間どうしのマッピング.
combinat: 組合せ論のユーティリティ.
compOverlapCorr: (共通の変数を持つという意味で) 重なり合っている 2つの相関係数を比較します.
compositions: 組成データ (たとえば, 物質の構成比) および正の数 (たとえば, 濃度) の一貫性分析のための関数群.
concor: コンコーダンス. "ブロックによる特異値分解 (SVD)" を提供します (Concordance, providing "SVD by blocks").
concord: コンコーダンスと信頼性の尺度 (Measures of concordance and reliability).
conf.design: 交絡および一部実施計画 (confounded and fractional factorial designs) を構築・操作するための一続きの簡単なツール群.
connectedness: 2元分類について非連結集合 (disconnected sets) を発見します.
copula: 一般的に利用されるコピュラのクラス (楕円およびアルキメデス・コピュラを含む). そして確率密度, 分布, 乱数発生器, プロットのための手法.
corpora: コーパスの頻度データの統計分析のためのユーティリティ関数群.
corpcor: 共分散および (偏) 相関の効率的な推定.
corrgram: コレログラムをプロットします.
covRobust: 最近傍クリーニング法 (nearest neighbor cleaning) によるロバストな共分散の推定.
coxrobust: Cox 比例ハザード回帰モデルにおけるロバストな推定.
cramer: 多変量ノンパラメトリック Cramer 検定のためのルーチン.
crossdes: 持ち越し (キャリーオーバー) のバランスを取ったクロスオーバー計画の構築およびランダム化, 所与の計画のバランスの検証, そして 2つのランダム化処理の妥当性についてのシミュレーション研究のための関数群.
crq: ランダム打ち切りデータのためのクォンタイル回帰.
cslogistic: conditionally specified (条件付き確率で記述された) ロジスティック回帰モデルの尤度および事後分析.
cts: 連続時間自己回帰モデルおよびカルマン・フィルター.
ctv: CRAN task views (課題別一覧) のためのサーバー・サイド/クライアント・サイドのツール群.
cwhmisc: Christian W. Hoffmann による種々の関数群.
cyclones: サイクロンの同定.