R FAQ v2.4 - 5章の日本語訳 (5.1.2 [n-q])


nFDR
Bernstein 多項式に基づく FDR のノンパラメトリック推定.
nFactors
Cattell のスクリー検定 (Scree Test) に対するグラフを用いない解法.
ncdf
Unidata netCDF データ・ファイルとのインターフェイス.
ncomplete
観測値のデータセットからいくつかの観測値データを削除して, その削除後のデータセットが完全分離を持つようにするための, 削除できる観測値の数の最小値を概算するために, 2値回帰 (binary regression) に対して regression depth (回帰深度?) 法 (RDM) を実行するための関数群.
ncvar
netCDF データセットとの高水準の R インターフェイス.
negenes
ランダムなトランスポゾン突然変異誘発 (transposon mutagenesis) 実験から得られたデータに基づき, Gibbs サンプラーを用いて, ゲノム上の必須遺伝子 (essential genes) の数を推定します.
network
ネットワーク・オブジェクトを生成したり修正するためのツール集. 種々のリレーショナル・データ型を表現することができます.
neural
グラフィカル・ユーザー・インターフェイス付きの RBF および MLP ニューラル・ネットワーク.
nice
実行中の R プロセスについての UNIX の優先度 (nice 値) の取得あるいは nice 値の設定.
nlme
ガウス線形および非線形の混合効果モデルの当てはめおよび比較を行います. 推奨 (Recommended).
nlmeODE
微分方程式を用いた混合効果モデリングのために nlme および odesolve を組み合わせます.
nltm
生存分析のための非線形変換モデル (NonLinear Transformation Models for survival analysis).
nnet
単一の隠れ層パーセプトロン (hidden layer perceptrons) ("フィード-フォワード・ニューラル・ネットワーク"), および多項対数線形モデル (multinomial log-linear models) のためのソフトウェア. `VR' バンドルに含まれています. 推奨 (Recommended).
nor1mix
1次元正規混合モデルのクラス. (たとえば) 密度の推定あるいはクラスタリングアルゴリズムの研究および授業用に利用できます; そして, 広く使われている Marron-Wand 密度を提供します.
norm
欠損値を持つ多変量正規データセットの分析.
normalp
次数 p の正規分布 (一般の誤差分布) (normal of order p distributions (General Error Distributions)) に関するユーティリティ集.
nortest
正規性についての複合仮説に関する 5つのオムニバス検定 (Five omnibus tests for the composite hypothesis of normality).
noverlap
観測値のオーバーラップ量, つまり, 観測値のデータセットからいくつかの観測値データを削除して, その削除後のデータセットにオーバーラップがないようにするために削除が必要な観測値の数の最小値を概算するために, 2値回帰 (binary regression) に対して regression depth (回帰深度?) 法 (RDM) を実行するための関数群.
np
混合したデータ型についてのノンパラメトリックカーネル平滑化法.
npmc
ノンパラメトリック多重比較 (Nonparametric Multiple Comparisons): 特定の分布を仮定することなしで, 一元配置についての同時順位検定 (simultaneous rank test) 処理を提供します.
nsRFA
教師なしの地域頻度解析 (Non-supervised Regional Frequency Analysis).
numDeriv
正確な数値微分.
nws
NetWorkSpaces および Sleigh のための関数群.


odesolve
常微分方程式 (Ordinary Differential Equation (ODE)) のソルバー lsoda のためのインターフェイス. ODEs が R の関数として表現されます.
odfWeave
Open Document Format (ODF) ファイルの Sweave 処理.
onion
4元数 (クォータニオン) (quaternions) および 8元数 (octonions) を操作したり可視化するためのルーチン集.
optmatch
最適マッチング (optimal matching), とくに完全マッチング (full matching) を行うための関数群.
orientlib
向き SO(3) データの表現, 変換および表示.
ouch
系統発生学的比較仮説についての Ornstein-Uhlenbeck モデル.
outliers
外れ値を識別するために広く用いられているいくつかの検定集.
oz
オーストラリアの海岸線および州境をプロットするための関数群.


pARtial
(部分的) 寄与リスクの推定値, 対応する分散の推定値および信頼区間 *1 の スケルトン (ugraph) の標準的かつロバストな推定.
pcurve
任意次元の数値的多変量データセットに主曲線 (principal curve) を当てはめます. また, 診断プロットを作り, Bray-Curtis およびその他の距離行列を計算し, 多次元尺度および主成分分析を実行します.
pear
周期的自己回帰分析 (Periodic Autoregression Analysis).
permax
DNA アレイ・データについてのある種の基本的な分析, とくに, 2つのタイプの組織の間での発現量の比較に関する分析を容易にすることを意図した関数群.
permtest
2つのグループ内のばらつきとグループ間の距離を比較するための並べ替え検定 (Permutation test to compare variability within and distance between two groups).
perturb
共線性を評価するための摂動解析 (Perturbation analysis for evaluating collinearity).
pgam
ポアソン-ガンマ加法モデル (Poisson-Gamma Additive Models).
pgirmess
生態学および空間データの分析および表示のための関数群.
pheno
(植物の) 生物季節学 (フェノロジー) データセット *2.
plsgenomics
ゲノミクスのための PLS 分析.
pmg
貧乏人のための GUI.
poLCA
多値変数の潜在クラス分析 (POlytomous variable Latent Class Analysis).
polspline
C. Kooperberg および共著者による多項式スプラインの当てはめについてのルーチン群 (polynomial spline fitting routines hazard regression). ハザード回帰 (hazard regression), 柔軟な裾を持つハザード推定 (hazard estimation with flexible tails), 対数スプライン (logspline), スペクトル分布の対数スプライン推定 (lspec (logspline estimation of a spectral distribution)), 多項回帰および多重分類 (polyclass (polychotomous regression and multiple classification)), および多変量適応型多項式スプライン回帰 (polymars (multivariate adaptive polynomial spline regression)).
polyapost
ポリア事後確率 (Polya posterior) のシミュレーション.
polycor
多分 (polychoric) 相関係数および polyserial 相関係数.
polynom
1変量多項式の操作についてのクラスを実装するための関数集.
popgen
統計的および集団遺伝学.
portfolio
ポートフォリオの分析および実装のためのクラス群.
portfolioSim
エクイティ・ポートフォリオ戦略をシミュレートするための枠組み.
powell
Powell の UObyQA アルゴリズムを用いて関数を最適化します.
powerpkg
罹患同胞対 (affected sib pair) および TDT (Transmission Disequilibrium Test) 計画についての検出力分析 (power analyses).
ppc
ピーク確率対比によるタンパク質の質量スペクトルの標本分類 (Sample classification of protein mass spectra by peak probabilty contrasts).
pps
PPS (サイズに比例する確率 (probability proportional to size)) 抽出法 (サンプリング) を用いて標本を選択するための関数群, 層別単純ランダム抽出法 (stratified simple random sampling) のための関数群, および PPS 抽出についての Sampford の手法について結合包含確率 (joint inclusion probabilities) を計算するための関数群.
prabclus
クラスタリングについての距離ベースのパラメトリック・ブートストラップ検定. 主に, 存在-不在データ (種の分布マップのクラスタリング) を念頭に置いています. Jaccard および Kulczynski の距離測度, MDS スコアのクラスタリング, および最近傍ベースのノイズ検出.
prettyR
きれいな記述統計 (Pretty descriptive stats).
prim
患者のルール導出法 (Patient Rule Induction Method (PRIM)).
princurve
任意次元の点の行列に主曲線 (principal curve) を当てはめます.
proptest
Cox モデルにおける比例ハザード性の仮定 (proportional hazards assumption) についての検定.
proto
プロトタイプあるいは (クラス・ベースよりもむしろ) オブジェクト・ベースの オブジェクト指向の概念を用いたオブジェクト指向システム.
pscl
Political Science Computational Laboratory, Stanford University における R.
pspline
次数 m の導関数上の罰則を持つ平滑化スプライン (Smoothing splines with penalties on order m derivatives).
psy
精神測定学 (サイコメトリー) (psychometry) で用いられる種々の手続き: Kappa, ICC, Cronbach のアルファ, スクリープロット (screeplot), PCA および関連する手法.
psychometric
応用精神測定理論: 相関理論, メタアナリシス (妥当性一般化), 信頼性, 項目分析, 評価者間信頼性, および古典的効用 (Applied psychometric theory: functions useful for correlation theory, meta-analysis (validity-generalization), reliability, item analysis, inter-rater reliability, and classical utility).
pwr
検出力分析 (power analysis) についての基本的な関数群.
pwt
Penn World Table データ. 168ヶ国の 1950-2000年の一部あるいは全部についての購買力平価および国際価格に変換した国民所得勘定 (purchasing power parity and national income accounts converted to international prices) を提供します.
pvclust
p-値による階層型クラスタリング (Hierarchical clustering with p-value).


qcc
品質管理図 (Quality Control Charts). 連続値, 属性値, および計数データについての Shewhart の品質管理図. Cusum および EWMA 図. 検査特性曲線 (Operating characteristic curves). 工程能力 (Process capability) 分析. パレート図 (Pareto chart) および特性要因図 (cause-and-effect chart).
qgen
R を用いた量的遺伝学 (Quantitative Genetics).
qp
q-次偏相関グラフ探索アルゴリズム (q-order partial correlation graph search algorithm).
qtl
QTLs を同定するための実験的交雑 (experimental crosses) の分析.
qtlDesign
QTL 実験の計画のためのツール群.
qtlbim
QTL ベイズ区間マッピング (QTL Bayesian Interval Mapping).
quadprog
2次計画問題を解きます.
quantchem
定量化学分析 (Quantitative chemical analysis): 結果の校正および評価.
quantreg
クォンタイル回帰および関連手法.
quantregForest
クォンタイル回帰森 (Quantile Regression Forests), 条件付きクォンタイルの推定のためのツリー・ベースのアンサンブル手法.
qvalue
false discovery rate {有意であると判断された仮説の中で本当は有意でないものの比率} 制御のための q-値の推定.
qvcalc
近似誤差の準分散および関連測度 (quasi-variances and associated measures of approximation error) を計算するための関数群.

*1:Partial) attributable risk estimates, corresponding variance estimates and confidence intervals).

paleoTS
古生物学的時系列 (paleontological time-series) における進化のモデリング.
pamr
Pam: マイクロアレイに対する予測分析.
pan
多変量パネルあるいはクラスター化されたデータについての多重補填 (Multiple imputation for multivariate panel or clustered data).
panel
パネル・データにモデルを当てはめるための関数群およびデータセット.
papply
MPI を用いて並列的に apply (リストの各項目に対する関数の適用) を実行します.
partitions
整数の加法的分割 (Additive partitions of integers).
partsm
周期的自己回帰時系列モデル (Periodic AutoRegressive Time Series Models).
party
条件付き推論の枠組みでの偏りのない再帰的分割 (Unbiased recursive partitioning).
pastecs
時空間生態学的系列 (Space-Time Ecological Series) の分析のためのパッケージ
pbatR
R 内で PBAT を実行するためのフロントエンド.
pcaPP
射影追跡 (Projection Pursuit) によるロバストな PCA.
pcalg
PC アルゴリズムによる非循環有向グラフ (Directed Acyclic Graph (DAG

*2:plant-)phenological data sets) について時系列分析を行うためのいくつかの使いやすい関数群.

phpSerialize
R を PHP連想配列にシリアル化します.
pinktoe
S の木 (ツリー) を, インタラクティヴな木の走査ができるように HTML/Perl ファイルに変換します.
pixmap
ビットマップ画像についてインポート, エクスポート, プロット, およびその他の操作を行うための関数群.
plm
パネル・データについての線形モデル.
plotrix
プロットを強化するための種々の有用な関数群.
plugdensity
"プラグイン" による大域的なバンド幅選択を用いたカーネル密度推定 (Kernel density estimation with global bandwidth selection via "plug-in").
pls
部分最小二乗法回帰および主成分回帰 (Partial Least Squares Regression (PLSR) and Principal Component Regression (PCR